
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱动物 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
调查报告单
分析成员探讨跟着速冻时间隔廷长羊肉的洛氏硬性、持水力发电、有光泽、悬浮铁分量、ROS、脂质过脱色物、MDA、GSH和GPX4水平面来考核手臂肌肉组织机构组织的铁牺牲方式。可是体现,速冻时间隔廷长后,羊肉的洛氏硬性在第8天和第6天强势减低;持水效果调低;背景色变深,损失有光泽,鲜红色的的变的深褐色的的。再者,悬浮铁、活性氧氧和MDA的分量强势增添,组织凋亡率强势变高。 探索成员获取不相同冷冻箱周期的肌群原材料的淀粉酶质,再采取SDS-PAGE研究,淀粉酶质条带在不相同时代地理分布均且类同(图1a)。给出淀粉酶在不相同原材料中的表现时候,研究发现了一致组原材料的中五位数更加接近于一致质量(图1b),情况说明肌群原材料淀粉酶质有优秀的组内类同性和组间对比分析性。 营养物质质组学共技术认定出1996种营养物质质。以B0为對照组,筛分B1、B2、B4和B6中的营养物质参与对比研究展示研究,共技术认定到375个DEPs。将火山图交互式,并按照FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两位标准研究DEP。没想到图示1c-f图示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别技术认定出22、33、73和140个DEPs,至少分头别上涨6、11、32和84个,调低16、22、41和52。聚类分析法做法分析评估了各种不同食品冷藏关键时期力量策划 中营养物质质的展示,没想到表示力量营养物质展示对比研究因为永久保存时刻的增高而增高(图1g)。
图1| 与众不同冷库时光的肌肉组织图纸蛋白酶质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 有所不一致性冷冻箱的时间的健身肌肉样本不一致性蛋白质分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死忙核蛋白肽的PRM一定量介绍(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 来源于KEGG聚集差别抒发核蛋白的铁生亡系统(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人心得体会
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT一定量蛋白质酶质组学技术应用性功能,拜谱海洋生物已研发项目管理结束并建设了进一步优化完美的转录组学、蛋白质酶组学、分泌组学或多个学合力好产品技术应用性功能体系建设,欢迎致电咨询!
参考使用论文毕业论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.